Amerikaanse subsidie voor Delftse DNA-lezer

De National Institutes of Health (NIH), de Amerikaanse financierder van biomedisch onderzoek, kent bijna 2,5 miljoen dollar toe aan de TU Delft en de University of Illinois voor een methode om DNA te ’lezen‘. DNA is een zeer lang molecuul dat genetische informatie codeert met vier verschillende bouwstenen. Het bepalen van de volgorde van deze ’letters‘ is essentieel voor veel medisch onderzoek en in de toekomst waarschijnlijk voor de behandeling van patiënten. Maar de snelheid en kosten hiervan laten nog te wensen over.

Alhoewel er de laatste jaren enorme stappen zijn gezet in de efficiëntie van DNA-sequencen, is de methode in de basis nooit veranderd. Het Delfts-Amerikaanse methode wil wel een andere aanpak inzetten. De letters moeten uitgelezen worden door het DNA-molecuul door gaatjes van enkele nanometers in diameter te trekken. Op zich is dit idee niet nieuw, maar de onderzoekers willen er recente inzichten rond plasmonica op loslaten. Door een gouden nanostructuur die als optische antenne fungeert, ontstaan er precies rond het nanogaatje intense plasomonische velden. Deze versterken de Raman-verstrooiing, waarmrr gedetecteerd kan worden welke DNA-letter er door het nanogaatje beweegt. Ook kan de beweging van het molecuul door het gaatje ermee bepaald worden.

Het Delftse team zal binnen het project de experimenten uitvoeren, terwijl de Amerikanen de moleculaire dynamica proberen te simuleren. Het team krijgt overigens concurrentie; in totaal deelt het NIH 17 miljoen uit voor acht projecten naar DNA-sequencing met nanogaatjes.